Walter Weller est né à Vienne et devient membre du Wiener Philharmoniker à l'age de 17 ans. L´année suivante il fonde le Quatuor Weller, de réputation mondiale tout au long de ses dix années d'existence et qui produit de nombreux enregistrements remarquables. En 1961 il est promu
Konzertmeister au Wiener Philharmoniker et entame sa brillante carrière de chef d´orchestre en 1966. Il signe un contrat de longue durée avec le Wiener Staatsoper en 1969, et acquière ainsi un très large répertoire d´opéra.

De janvier 1992 à juillet 1997, Walter Weller a été directeur musical et chef principal du Royal Scottish National Orchestra, pour y devenir ensuite chef émérite. Les tournées qu'ils ont effectuées ensemble en Allemagne, Autriche et Suisse ont eu un succès retentissant. Mr. Weller s´est vu décerner le titre de « conductor laureate » par le Stuttgart Philharmonic Orchestra et occupe la fonction de directeur associé à l'Orchestre de Valence en Espagne. Il a été directeur artistique de l'Allgemeine Musikgesellschaft Basel, directeur musical général du Theater Basel, et premier chef du Basel Symphony Orchestra entre Septembre 1994 et juillet 1997, chef principal du Royal Philharmonic Orchestra de 1980 à 1985 et directeur musical et artistique du Royal Liverpool Philharmonic de 1977 à 1980.

Mr. Weller est régulièrement invité à diriger les plus grands orchestres du monde et a ainsi travaillé avec le London Symphony Orchestra, Philharmonia Orchestra, BBC Symphony Orchestra, Dresden Staatskapelle, RSO Berlin, Leipzig Gewandhaus, Orchestre de Paris, Royal Concertgebouw Orchestra, WDR Köln, Il entretient une relation privilégiée avec le RTVE de Madrid et le Trondheim Symphony Orchestra. Les principaux engagements à venir le conduiront au Czech Philharmonic, à l'Orchestre de la Suisse Romande, City of Birmingham Symphony Orchestra, BBC National Orchestra of Wales, Gothenburg Symphony ainsi que les Orchestres Philharmoniques de Varsovie et Strasbourg.

En ce qui concerne l'opéra, Mr. Weller a dirigé notamment Der Fliegende Holländer à La Scala, Ariadne auf Naxos et Der Fliegende Holländer à l'English National Oper, une nouvelle production de Der Freischütz au Teatro Comunale de Bologne, une nouvelle production du Prince Igor au
Berlin Staatskapelle, Fidelio et Der Rosenkavalier pour le Scottish Opera. En février 2004, il a dirigé une nouvelle production de Cosi fan Tutte avec l'Opéra de Monte Carlo dirigé par John Cox et il y retourna pour Der Rosenkavalier en 2006-2007.

Depuis 2007-2008, Walter Weller est directeur musical de l'Orchestre National de Belgique et il l'a déjà emmené en tournée en Espagne et en Allemagne, ainsi qu'à St. Riquier, Amsterdam et Eltville im Rheingau.

L'importante discographie de Mr. Weller compte des enregistrements pour Decca, EMI, Collins Classics, Fuga Libra, Harmonia Mundi et Chandos Records, avec qui il a produit toutes le symphonies de Beethoven avec le City of Birminghman Symphony Orchestra ( y compris la Symphonie n°10).

Sa brillante carrière s'est vue récompensée par de nombreuses distinctions: 22 décembre 1998 le gouvernement autrichien l'a honoré du « Große Silberne Ehrenzeichen » pour services rendus à la république, distinction qui avait également été décernée à Josef Kripps et Herbert von Karajan. Il a également reçu la médaille de la Beethoven Society, le prix Mozart de l'interprétation en en 1999, la médaille du « Outstanding People of the 20th Century » et des « 100 best musicians of 2007 » de l'International Biographical Centre de Cambridge.